SS-31
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  • 分子式:C32H49N9O5
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分子式: C32H49N9O5

产品概述

SS-31 是一种人工设计的芳香族阳离子四肽,在科研文献中也常见于 Elamipretide、MTP-131 等名称体系。

其氨基酸序列为:

D-Arg-Dmt-Lys-Phe-NH2

其中 Dmt 指 2',6'-dimethyltyrosine,即 2',6'-二甲基酪氨酸。SS-31 由 D-构型精氨酸、Dmt、赖氨酸和苯丙氨酸组成,并具有 C 端酰胺化结构。

这种紧凑的四肽骨架同时具有阳离子和芳香性特征,因此在基础研究中常用于线粒体膜环境、Cardiolipin 相互作用、多肽-脂质识别以及短肽结构-功能关系等方向。

本页面主要介绍 SS-31 的分子结构、线粒体相关科研背景以及常见分析表征方法。

分子与结构信息

项目 信息
名称 SS-31
文献常见名称 Elamipretide、MTP-131
多肽类型 芳香族阳离子四肽
肽链长度 4 个氨基酸残基
氨基酸序列 D-Arg-Dmt-Lys-Phe-NH2
Dmt 2',6'-Dimethyltyrosine
分子式 C32H49N9O5
分子量 约 639.8 g/mol
C端形式 酰胺化
结构特征 D-氨基酸、芳香族侧链、阳离子残基、C端酰胺化
主要研究方向 线粒体内膜、Cardiolipin、多肽-脂质相互作用及短肽结构研究

结构特点

紧凑的四肽骨架

SS-31 仅由四个氨基酸残基组成,但其结构并不简单。

D-Arg 和 Lys 提供带正电荷的侧链,而 Dmt 和 Phe 则带来较明显的芳香性和疏水性特征。不同类型的侧链集中在较短的肽链中,使 SS-31 成为研究短肽分子识别和膜环境相互作用时较有代表性的模型分子。

D-Arg 的立体化学特征

SS-31 的 N 端为 D-构型精氨酸。

D-氨基酸与天然蛋白中更常见的 L-氨基酸具有不同的立体构型,因此在多肽研究中,可用于观察立体化学变化对构象、分子识别以及相互作用行为的影响。

Dmt 芳香族残基

Dmt 是 2',6'-dimethyltyrosine 的缩写。

与普通 Tyr 相比,Dmt 的芳香环上增加了两个甲基取代基,使其在空间结构和疏水性方面表现出不同特征。

Dmt 与 Phe 共同构成 SS-31 中较为明显的芳香族结构区域,也是研究其与脂质环境发生相互作用时的重要结构因素之一。

C端酰胺化

SS-31 的 C 端为 Phe-NH2。

C端酰胺化改变了肽链末端的电荷状态和局部化学环境,因此在分析 SS-31 的分子结构、质谱结果以及不同结构形式时,应将末端修饰纳入考虑。

线粒体相关研究背景

线粒体内膜研究

SS-31 经常出现在与线粒体内膜相关的基础研究中。

线粒体内膜具有不同于普通细胞膜的脂质组成和分子组织方式,其中 Cardiolipin 是较具有代表性的特征脂质之一。

围绕 SS-31 的研究通常关注以下问题:

  • 短肽在特殊膜环境中的分布行为
  • 多肽与线粒体膜脂之间的相互作用
  • 电荷和芳香族侧链对脂质识别的影响
  • 膜环境对多肽构象和分子行为的影响
  • 线粒体膜结构与分子功能之间的关系

这些研究主要属于线粒体生物学、生物物理学和多肽化学领域。

Cardiolipin 相互作用研究

Cardiolipin 的研究意义

Cardiolipin,中文通常称为心磷脂,是线粒体内膜中具有代表性的磷脂成分。

由于其特殊的分子结构和在线粒体内膜中的分布,Cardiolipin 经常被用于研究膜结构、膜蛋白组织以及线粒体相关分子相互作用。

SS-31 与 Cardiolipin

SS-31 是 Cardiolipin interaction 研究中较常见的短肽模型之一。

相关工作通常关注:

  • 多肽与 Cardiolipin 的相互作用
  • 多肽与膜脂之间的分子识别
  • 芳香族残基在脂质环境中的作用
  • 阳离子结构对带负电膜组分的影响
  • 膜结合状态下的多肽行为

这些研究有助于从分子层面理解短肽与膜脂之间的相互作用方式。

多肽-脂质相互作用

SS-31 的结构同时具有带正电残基和芳香族侧链,因此可作为研究多肽-脂质相互作用的模型分子。

科研中通常关注以下关系:

多肽结构 → 脂质识别 → 膜环境中的分子行为

这种研究思路不仅适用于 SS-31,也适用于其他具有明确电荷分布和芳香族结构特征的短肽。

线粒体结构与分子行为研究

线粒体研究并不仅限于单一分子,而是涉及膜脂、蛋白复合物、膜结构和能量相关体系之间的相互关系。

SS-31 相关基础研究通常涉及:

  • 线粒体膜生物学
  • Cardiolipin 相关研究
  • 线粒体膜组织
  • 多肽-脂质相互作用
  • 线粒体结构生物学
  • 膜环境中的短肽行为

相关实验可以在体外生化体系、细胞模型、膜模拟体系或其他受控研究条件下进行。

不同实验模型得到的结果,应结合具体实验条件和研究对象进行解读,不宜直接延伸为临床结论。

结构-功能关系研究

SS-31 的肽链虽然很短,但同时包含多种具有研究价值的结构元素:

  • D-Arg
  • Dmt
  • Lys
  • Phe
  • 阳离子残基
  • 芳香族侧链
  • C端酰胺化

这些结构特点使其适合用于短肽结构-功能关系研究。

研究中可以通过改变特定位点,观察以下因素对分子行为的影响:

  • D-与L-氨基酸构型
  • 芳香族残基类型
  • 电荷分布
  • 疏水性
  • C端结构
  • 氨基酸替换

通过这些比较,可以进一步分析短肽的序列、立体化学、侧链性质与膜相互作用之间的关系。

SS-31 与不同分子形式

在科研文献和数据库中,SS-31、Elamipretide 以及相关盐型可能以不同的化学形式出现。

游离形式、盐型以及其他制剂相关形式,在以下方面可能存在差异:

  • 分子组成
  • 分子量
  • 离子状态
  • 分析结果
  • 色谱行为

因此,在比较不同文献或实验数据时,不宜只根据名称判断是否为完全相同的分子形式。

更可靠的判断方式是同时核对:

  • 氨基酸序列
  • 分子式
  • 分子量
  • C端结构
  • 盐型
  • 分析数据

这样可以减少不同结构形式之间的混淆。

分析与结构表征

SS-31 可采用常见的多肽分析技术进行分子身份和结构研究。

常用方法包括:

  • 高效液相色谱 HPLC
  • 质谱 MS
  • LC-MS
  • 分子量确认
  • 氨基酸序列分析
  • Peptide mapping
  • 末端结构分析
  • 修饰位点相关分析

HPLC 可用于观察样品中的主要组分及相关峰信息。

MS 和 LC-MS 则可结合理论分子量,对多肽分子身份和结构特征进行进一步分析。

由于 SS-31 含有 D-Arg、Dmt 和 C端酰胺化等特殊结构,分析结果应结合完整分子结构进行解释,而不能只依据多肽名称进行判断。

FAQ

SS-31 是什么类型的多肽?

SS-31 是一种由四个氨基酸残基组成的芳香族阳离子短肽,常用于线粒体膜、Cardiolipin 以及多肽-脂质相互作用等基础研究。

SS-31 的氨基酸序列是什么?

其序列为:

D-Arg-Dmt-Lys-Phe-NH2

其中 Dmt 指 2',6'-dimethyltyrosine。

Dmt 是什么?

Dmt 是 2',6'-dimethyltyrosine,即 2',6'-二甲基酪氨酸。它属于具有芳香族侧链特征的修饰型氨基酸。

为什么 SS-31 被称为芳香族阳离子多肽?

因为其结构中同时包含 D-Arg、Lys 等带正电残基,以及 Dmt、Phe 等芳香族残基,因此具有明显的阳离子和芳香性结构特征。

为什么 SS-31 经常用于 Cardiolipin 相关研究?

SS-31 的电荷分布和芳香族结构,使其适合作为研究短肽与 Cardiolipin 及其他膜脂之间分子相互作用的模型。

SS-31 和 Elamipretide 是什么关系?

在科研文献中,SS-31 和 Elamipretide 常用于描述同一核心四肽结构相关分子。具体研究中仍应进一步核对分子形式、盐型、分子量和分析信息。

SS-31 常采用哪些方法进行分析?

常见方法包括 HPLC、MS、LC-MS、分子量确认、序列分析、Peptide mapping 以及末端结构分析。

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