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分子式: C32H49N9O5
产品概述
SS-31 是一种人工设计的芳香族阳离子四肽,在科研文献中也常见于 Elamipretide、MTP-131 等名称体系。
其氨基酸序列为:
D-Arg-Dmt-Lys-Phe-NH2
其中 Dmt 指 2',6'-dimethyltyrosine,即 2',6'-二甲基酪氨酸。SS-31 由 D-构型精氨酸、Dmt、赖氨酸和苯丙氨酸组成,并具有 C 端酰胺化结构。
这种紧凑的四肽骨架同时具有阳离子和芳香性特征,因此在基础研究中常用于线粒体膜环境、Cardiolipin 相互作用、多肽-脂质识别以及短肽结构-功能关系等方向。
本页面主要介绍 SS-31 的分子结构、线粒体相关科研背景以及常见分析表征方法。
分子与结构信息
| 项目 | 信息 |
|---|---|
| 名称 | SS-31 |
| 文献常见名称 | Elamipretide、MTP-131 |
| 多肽类型 | 芳香族阳离子四肽 |
| 肽链长度 | 4 个氨基酸残基 |
| 氨基酸序列 | D-Arg-Dmt-Lys-Phe-NH2 |
| Dmt | 2',6'-Dimethyltyrosine |
| 分子式 | C32H49N9O5 |
| 分子量 | 约 639.8 g/mol |
| C端形式 | 酰胺化 |
| 结构特征 | D-氨基酸、芳香族侧链、阳离子残基、C端酰胺化 |
| 主要研究方向 | 线粒体内膜、Cardiolipin、多肽-脂质相互作用及短肽结构研究 |
结构特点
紧凑的四肽骨架
SS-31 仅由四个氨基酸残基组成,但其结构并不简单。
D-Arg 和 Lys 提供带正电荷的侧链,而 Dmt 和 Phe 则带来较明显的芳香性和疏水性特征。不同类型的侧链集中在较短的肽链中,使 SS-31 成为研究短肽分子识别和膜环境相互作用时较有代表性的模型分子。
D-Arg 的立体化学特征
SS-31 的 N 端为 D-构型精氨酸。
D-氨基酸与天然蛋白中更常见的 L-氨基酸具有不同的立体构型,因此在多肽研究中,可用于观察立体化学变化对构象、分子识别以及相互作用行为的影响。
Dmt 芳香族残基
Dmt 是 2',6'-dimethyltyrosine 的缩写。
与普通 Tyr 相比,Dmt 的芳香环上增加了两个甲基取代基,使其在空间结构和疏水性方面表现出不同特征。
Dmt 与 Phe 共同构成 SS-31 中较为明显的芳香族结构区域,也是研究其与脂质环境发生相互作用时的重要结构因素之一。
C端酰胺化
SS-31 的 C 端为 Phe-NH2。
C端酰胺化改变了肽链末端的电荷状态和局部化学环境,因此在分析 SS-31 的分子结构、质谱结果以及不同结构形式时,应将末端修饰纳入考虑。
线粒体相关研究背景
线粒体内膜研究
SS-31 经常出现在与线粒体内膜相关的基础研究中。
线粒体内膜具有不同于普通细胞膜的脂质组成和分子组织方式,其中 Cardiolipin 是较具有代表性的特征脂质之一。
围绕 SS-31 的研究通常关注以下问题:
- 短肽在特殊膜环境中的分布行为
- 多肽与线粒体膜脂之间的相互作用
- 电荷和芳香族侧链对脂质识别的影响
- 膜环境对多肽构象和分子行为的影响
- 线粒体膜结构与分子功能之间的关系
这些研究主要属于线粒体生物学、生物物理学和多肽化学领域。
Cardiolipin 相互作用研究
Cardiolipin 的研究意义
Cardiolipin,中文通常称为心磷脂,是线粒体内膜中具有代表性的磷脂成分。
由于其特殊的分子结构和在线粒体内膜中的分布,Cardiolipin 经常被用于研究膜结构、膜蛋白组织以及线粒体相关分子相互作用。
SS-31 与 Cardiolipin
SS-31 是 Cardiolipin interaction 研究中较常见的短肽模型之一。
相关工作通常关注:
- 多肽与 Cardiolipin 的相互作用
- 多肽与膜脂之间的分子识别
- 芳香族残基在脂质环境中的作用
- 阳离子结构对带负电膜组分的影响
- 膜结合状态下的多肽行为
这些研究有助于从分子层面理解短肽与膜脂之间的相互作用方式。
多肽-脂质相互作用
SS-31 的结构同时具有带正电残基和芳香族侧链,因此可作为研究多肽-脂质相互作用的模型分子。
科研中通常关注以下关系:
多肽结构 → 脂质识别 → 膜环境中的分子行为
这种研究思路不仅适用于 SS-31,也适用于其他具有明确电荷分布和芳香族结构特征的短肽。
线粒体结构与分子行为研究
线粒体研究并不仅限于单一分子,而是涉及膜脂、蛋白复合物、膜结构和能量相关体系之间的相互关系。
SS-31 相关基础研究通常涉及:
- 线粒体膜生物学
- Cardiolipin 相关研究
- 线粒体膜组织
- 多肽-脂质相互作用
- 线粒体结构生物学
- 膜环境中的短肽行为
相关实验可以在体外生化体系、细胞模型、膜模拟体系或其他受控研究条件下进行。
不同实验模型得到的结果,应结合具体实验条件和研究对象进行解读,不宜直接延伸为临床结论。
结构-功能关系研究
SS-31 的肽链虽然很短,但同时包含多种具有研究价值的结构元素:
- D-Arg
- Dmt
- Lys
- Phe
- 阳离子残基
- 芳香族侧链
- C端酰胺化
这些结构特点使其适合用于短肽结构-功能关系研究。
研究中可以通过改变特定位点,观察以下因素对分子行为的影响:
- D-与L-氨基酸构型
- 芳香族残基类型
- 电荷分布
- 疏水性
- C端结构
- 氨基酸替换
通过这些比较,可以进一步分析短肽的序列、立体化学、侧链性质与膜相互作用之间的关系。
SS-31 与不同分子形式
在科研文献和数据库中,SS-31、Elamipretide 以及相关盐型可能以不同的化学形式出现。
游离形式、盐型以及其他制剂相关形式,在以下方面可能存在差异:
- 分子组成
- 分子量
- 离子状态
- 分析结果
- 色谱行为
因此,在比较不同文献或实验数据时,不宜只根据名称判断是否为完全相同的分子形式。
更可靠的判断方式是同时核对:
- 氨基酸序列
- 分子式
- 分子量
- C端结构
- 盐型
- 分析数据
这样可以减少不同结构形式之间的混淆。
分析与结构表征
SS-31 可采用常见的多肽分析技术进行分子身份和结构研究。
常用方法包括:
- 高效液相色谱 HPLC
- 质谱 MS
- LC-MS
- 分子量确认
- 氨基酸序列分析
- Peptide mapping
- 末端结构分析
- 修饰位点相关分析
HPLC 可用于观察样品中的主要组分及相关峰信息。
MS 和 LC-MS 则可结合理论分子量,对多肽分子身份和结构特征进行进一步分析。
由于 SS-31 含有 D-Arg、Dmt 和 C端酰胺化等特殊结构,分析结果应结合完整分子结构进行解释,而不能只依据多肽名称进行判断。
FAQ
SS-31 是什么类型的多肽?
SS-31 是一种由四个氨基酸残基组成的芳香族阳离子短肽,常用于线粒体膜、Cardiolipin 以及多肽-脂质相互作用等基础研究。
SS-31 的氨基酸序列是什么?
其序列为:
D-Arg-Dmt-Lys-Phe-NH2
其中 Dmt 指 2',6'-dimethyltyrosine。
Dmt 是什么?
Dmt 是 2',6'-dimethyltyrosine,即 2',6'-二甲基酪氨酸。它属于具有芳香族侧链特征的修饰型氨基酸。
为什么 SS-31 被称为芳香族阳离子多肽?
因为其结构中同时包含 D-Arg、Lys 等带正电残基,以及 Dmt、Phe 等芳香族残基,因此具有明显的阳离子和芳香性结构特征。
为什么 SS-31 经常用于 Cardiolipin 相关研究?
SS-31 的电荷分布和芳香族结构,使其适合作为研究短肽与 Cardiolipin 及其他膜脂之间分子相互作用的模型。
SS-31 和 Elamipretide 是什么关系?
在科研文献中,SS-31 和 Elamipretide 常用于描述同一核心四肽结构相关分子。具体研究中仍应进一步核对分子形式、盐型、分子量和分析信息。
SS-31 常采用哪些方法进行分析?
常见方法包括 HPLC、MS、LC-MS、分子量确认、序列分析、Peptide mapping 以及末端结构分析。
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